Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms