Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd7E9Q9W7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms