Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930451I11RikE9Q9R3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930451I11RikE9Q9R3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms