Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc146E9Q9F7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc146E9Q9F7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms