Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm5407E9Q7Q1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Gm5407E9Q7Q1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Gm5407E9Q7Q1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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