Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6I0

Vmn2r116, Vomeronasal type-2 receptor 116, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r116E9Q6I0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn2r116E9Q6I0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn2r116E9Q6I0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn2r116E9Q6I0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn2r116E9Q6I0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn2r116E9Q6I0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn2r116E9Q6I0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r116E9Q6I0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r116E9Q6I0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r116E9Q6I0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms