Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms