Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm20518E9Q548 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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