Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms