Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930579F01RikE9Q3L6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms