Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pdzd2E9Q1M1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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