Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms