Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms