Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms