Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms