Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5415E9PXF3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms