Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc8E9PWG2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms