Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms