Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms