Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444G20RikD3Z741 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444G20RikD3Z741 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444G20RikD3Z741 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444G20RikD3Z741 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444G20RikD3Z741 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444G20RikD3Z741 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444G20RikD3Z741 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444G20RikD3Z741 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms