Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnf217D3YYI7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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