Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn24D3YXJ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms