Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrnnD3YUU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CrnnD3YUU6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrnnD3YUU6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrnnD3YUU6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrnnD3YUU6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrnnD3YUU6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrnnD3YUU6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrnnD3YUU6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrnnD3YUU6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms