Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms