Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok3bC0HKC9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms