Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptprz1B9EKR1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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