Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxpe3B9EKK6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms