Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms