Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms