Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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