Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms