Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AU015836B2RUM3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AU015836B2RUM3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms