Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprbB2RU80 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprbB2RU80 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprbB2RU80 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprbB2RU80 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprbB2RU80 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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