Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms