Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf518bB2RRE4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms