Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms