Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms