Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd5B1AYB6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms