Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms