Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms