Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prr29B1ARI9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr29B1ARI9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms