Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Tmem235B1AQL3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Tmem235B1AQL3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Tmem235B1AQL3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Tmem235B1AQL3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Tmem235B1AQL3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tmem235B1AQL3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tmem235B1AQL3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tmem235B1AQL3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tmem235B1AQL3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms