Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp36B1AQJ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms