Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms