Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint7A7XV04 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms