Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint5A7XUY5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Skint5A7XUY5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms