Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll11A4Q9F4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms