Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms