Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms