Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itga8A2ARA8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms